ডিজাইন স্কিম এবং পলিপেপটাইড পেপটাইড চেইনের সমাধান

I. সারাংশ
পেপটাইড হল বিশেষ ম্যাক্রোমোলিকুলস যে তাদের রাসায়নিক এবং শারীরিক বৈশিষ্ট্যে তাদের ক্রমগুলি অস্বাভাবিক।কিছু পেপটাইড সংশ্লেষিত করা কঠিন, অন্যদের সংশ্লেষ করা তুলনামূলকভাবে সহজ কিন্তু বিশুদ্ধ করা কঠিন।ব্যবহারিক সমস্যা হল যে বেশিরভাগ পেপটাইড জলীয় দ্রবণে সামান্য দ্রবণীয়, তাই আমাদের পরিশোধনে, হাইড্রোফোবিক পেপটাইডের সংশ্লিষ্ট অংশকে জলীয় দ্রাবকগুলিতে দ্রবীভূত করতে হবে, তাই, এই দ্রাবক বা বাফারগুলি ব্যবহারের সাথে গুরুতরভাবে অসঙ্গতিপূর্ণ হতে পারে। জৈবিক পরীক্ষামূলক পদ্ধতির, যাতে প্রযুক্তিবিদদের তাদের নিজস্ব উদ্দেশ্যে পেপটাইড ব্যবহার করা থেকে কঠোরভাবে নিষিদ্ধ করা হয়, যাতে নিম্নলিখিতগুলি গবেষকদের জন্য পেপটাইডের নকশার বিভিন্ন দিক রয়েছে।

ডিজাইন স্কিম এবং পলিপেপটাইড পেপটাইড চেইনের সমাধান
দ্বিতীয়ত, সিন্থেটিক কঠিন পেপটাইডের সঠিক পছন্দ
1. ডাউন-নিয়ন্ত্রিত সিকোয়েন্সের মোট দৈর্ঘ্য
15 টিরও কম অবশিষ্টাংশের পেপটাইডগুলি পাওয়া সহজ কারণ পেপটাইডের আকার বৃদ্ধি পায় এবং অপরিশোধিত পণ্যের বিশুদ্ধতা হ্রাস পায়।যেহেতু পেপটাইড চেইনের মোট দৈর্ঘ্য 20টি অবশিষ্টাংশের বেশি বৃদ্ধি পায়, তাই পণ্যের সঠিক পরিমাণ একটি মূল উদ্বেগের বিষয়।অনেক পরীক্ষায়, অবশিষ্টাংশ সংখ্যা 20 এর নিচে কমিয়ে অপ্রত্যাশিত প্রভাব পাওয়া সহজ।
2. হাইড্রোফোবিক অবশিষ্টাংশের সংখ্যা হ্রাস করুন
হাইড্রোফোবিক অবশিষ্টাংশের একটি বৃহৎ প্রাধান্য সহ পেপটাইড, বিশেষ করে সি-টার্মিনাস থেকে 7-12 অবশিষ্টাংশে, সাধারণত সিন্থেটিক অসুবিধা সৃষ্টি করে।এটি একটি অপর্যাপ্ত সংমিশ্রণ হিসাবে দেখা হয় কারণ সংশ্লেষণে একটি বি-ভাঁজ শীট পাওয়া যায়।"এই ধরনের ক্ষেত্রে, এটি দুটির বেশি ইতিবাচক এবং নেতিবাচক অবশিষ্টাংশকে রূপান্তর করতে বা পেপটাইড রচনাটি আনলক করার জন্য পেপটাইডে গ্লাই বা প্রো রাখা দরকারী হতে পারে।"
3. "কঠিন" অবশিষ্টাংশের নিয়ন্ত্রণ
"এখানে অনেকগুলি Cys, Met, Arg এবং Try অবশিষ্টাংশ রয়েছে যা সাধারণত সহজেই সংশ্লেষিত হয় না।"Ser সাধারণত Cys-এর ননঅক্সিডেটিভ বিকল্প হিসেবে ব্যবহার করা হবে।
ডিজাইন স্কিম এবং পলিপেপটাইড পেপটাইড চেইনের সমাধান

তৃতীয়ত, পানিতে দ্রবণীয় সঠিক পছন্দ উন্নত করুন
1. N বা C টার্মিনাস সামঞ্জস্য করুন
অ্যাসিডিক পেপটাইডের সাথে সম্পর্কিত (অর্থাৎ, pH 7 এ ঋণাত্মকভাবে চার্জ করা হয়), অ্যাসিটিলেশন (N-টার্মিনাস অ্যাসিটিলেশন, সি টার্মিনাস সর্বদা একটি মুক্ত কার্বক্সিল গ্রুপ বজায় রাখে) নেতিবাচক চার্জ বাড়ানোর জন্য বিশেষভাবে সুপারিশ করা হয়।যাইহোক, মৌলিক পেপটাইডগুলির জন্য (অর্থাৎ, pH 7 এ ইতিবাচকভাবে চার্জ করা হয়), অ্যামিনেশন (এন-টার্মিনাসে বিনামূল্যে অ্যামিনো গ্রুপ এবং সি-টার্মিনাসে অ্যামিনেশন) বিশেষভাবে পজিটিভ চার্জ বাড়ানোর পরামর্শ দেওয়া হয়।

2. ক্রমটি ব্যাপকভাবে ছোট বা লম্বা করুন

কিছু সিকোয়েন্সে প্রচুর পরিমাণে হাইড্রোফোবিক অ্যামিনো অ্যাসিড থাকে, যেমন Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr এবং Ala ইত্যাদি। যখন এই হাইড্রোফোবিক অবশিষ্টাংশগুলি 50% অতিক্রম করে, তখন সেগুলি সাধারণত সহজে দ্রবীভূত হয় না।পেপটাইডের ইতিবাচক এবং নেতিবাচক মেরুগুলিকে আরও বাড়ানোর জন্য ক্রমটি দীর্ঘ করা কার্যকর হতে পারে।দ্বিতীয় বিকল্পটি হল হাইড্রোফোবিক অবশিষ্টাংশগুলিকে হ্রাস করে ইতিবাচক এবং নেতিবাচক মেরুগুলিকে বৃদ্ধি করতে পেপটাইড চেইনের আকারকে হ্রাস করা।পেপটাইড চেইনের ইতিবাচক এবং নেতিবাচক দিকগুলি যত বেশি শক্তিশালী, জলের সাথে প্রতিক্রিয়া হওয়ার সম্ভাবনা তত বেশি।
3. একটি জল দ্রবণীয় অবশিষ্টাংশ রাখুন
কিছু পেপটাইড চেইনের জন্য, কিছু ইতিবাচক এবং নেতিবাচক অ্যামিনো অ্যাসিডের সংমিশ্রণ জলের দ্রবণীয়তা উন্নত করতে পারে।আমাদের কোম্পানি অ্যাসিডিক পেপটাইডের এন-টার্মিনাস বা সি-টার্মিনাসকে গ্লু-গ্লু-এর সাথে একত্রিত করার পরামর্শ দেয়।মৌলিক পেপটাইডের N বা C টার্মিনাস দেওয়া হয়েছিল এবং তারপরে Lys-Lys।যদি চার্জ করা গ্রুপ স্থাপন করা না যায়, Ser-Gly-Ser N বা C টার্মিনাসেও স্থাপন করা যেতে পারে।যাইহোক, এই পদ্ধতিটি কাজ করে না যখন পেপটাইড চেইনের দিকগুলি পরিবর্তন করা যায় না।