অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল পেপটাইডের চারটি বৈশিষ্ট্য

এই অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল পেপটাইডগুলি মূলত কীটপতঙ্গ, স্তন্যপায়ী প্রাণী, উভচর ইত্যাদির প্রতিরক্ষা ব্যবস্থা থেকে উদ্ভূত হয়েছিল এবং তারা প্রধানত চারটি বিভাগ অন্তর্ভুক্ত করে:

1. সেক্রোপিন মূলত সেক্রোপিয়ামথের ইমিউন লিম্ফে উপস্থিত ছিল, যা প্রধানত অন্যান্য পোকামাকড়ের মধ্যে পাওয়া যায় এবং অনুরূপ ব্যাকটেরিয়াঘটিত পেপটাইডগুলি শূকরের অন্ত্রেও পাওয়া যায়।এগুলি সাধারণত একটি দৃঢ়ভাবে ক্ষারীয় এন-টার্মিনাল অঞ্চল দ্বারা চিহ্নিত করা হয় যার পরে একটি দীর্ঘ হাইড্রোফোবিক টুকরা থাকে।

2. জেনোপাস অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল পেপটাইড (ম্যাগেনিন) ব্যাঙের পেশী এবং পেট থেকে উদ্ভূত হয়।জেনোপাস অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল পেপটাইডের গঠনও হেলিকাল হিসেবে পাওয়া গেছে, বিশেষ করে হাইড্রোফোবিক পরিবেশে।লিপিড স্তরগুলিতে জেনোপাস অ্যান্টিপেপটাইডগুলির কনফিগারেশন এন-লেবেলযুক্ত সলিড-ফেজ এনএমআর দ্বারা অধ্যয়ন করা হয়েছিল।অ্যাসিলামাইন রেজোন্যান্সের রাসায়নিক পরিবর্তনের উপর ভিত্তি করে, জেনোপাস অ্যান্টিপেপটাইডের হেলিসগুলি সমান্তরাল বাইলেয়ার পৃষ্ঠ ছিল এবং তারা 30 মিমি পর্যায়ক্রমিক হেলিকাল কাঠামোর সাথে একটি 13 মিমি খাঁচা তৈরি করতে পারে।

3. ডিফেন্সিন ডিফেন্স পেপটাইডগুলি সম্পূর্ণ নিউক্লিয়ার লোবিউল এবং প্রাণীদের অন্ত্রের কোষ সহ মানুষের পলিক্যারিওটিক নিউট্রোফিল খরগোশের পলিম্যাক্রোফেজ থেকে প্রাপ্ত।স্তন্যপায়ী প্রতিরক্ষা পেপটাইডের অনুরূপ অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল পেপটাইডের একটি দল কীটপতঙ্গ থেকে বের করা হয়েছিল, যাকে "পতঙ্গ প্রতিরক্ষা পেপটাইড" বলা হয়।স্তন্যপায়ী প্রতিরক্ষা পেপটাইডের বিপরীতে, পোকামাকড় প্রতিরক্ষা পেপটাইড শুধুমাত্র গ্রাম-পজিটিভ ব্যাকটেরিয়ার বিরুদ্ধে সক্রিয়।এমনকি পোকামাকড় প্রতিরক্ষা পেপটাইডে ছয়টি Cys অবশিষ্টাংশ থাকে, তবে একে অপরের সাথে ডিসালফাইড বন্ধনের পদ্ধতি ভিন্ন।ড্রোসোফিলা মেলানোগাস্ট থেকে নিষ্কাশিত অ্যান্টিব্যাকটেরিয়াল পেপটাইডের ইন্ট্রামলিকুলার ডিসালফাইড ব্রিজ বাইন্ডিং মোড উদ্ভিদ প্রতিরক্ষা পেপটাইডের মতোই ছিল।স্ফটিক অবস্থার অধীনে, প্রতিরক্ষা পেপটাইডগুলি ডাইমার হিসাবে উপস্থাপিত হয়।

4. Tachyplesin হর্সশু কাঁকড়া থেকে উদ্ভূত হয়, যাকে বলা হয় হর্সশোক্র্যাব।কনফিগারেশন অধ্যয়ন দেখায় যে এটি একটি সমান্তরাল বি-ভাঁজ কনফিগারেশন গ্রহণ করে (3-8 অবস্থান, 11-16 অবস্থান), যার মধ্যেβ-কোণ একে অপরের সাথে সংযুক্ত থাকে (8-11 অবস্থান), এবং দুটি ডিসালফাইড বন্ধন 7 এবং 12 অবস্থানের মধ্যে এবং 3 এবং 16 অবস্থানের মধ্যে তৈরি হয়।এই কাঠামোতে, হাইড্রোফোবিক অ্যামিনো অ্যাসিডটি সমতলের একপাশে অবস্থিত, এবং ছয়টি ক্যাটানিক অবশিষ্টাংশ অণুর লেজে উপস্থিত হয়, তাই গঠনটিও বায়োফিলিক।

এটি অনুসরণ করে যে প্রায় সমস্ত অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল পেপটাইড প্রকৃতিতে ক্যাটানিক, যদিও তারা দৈর্ঘ্য এবং উচ্চতায় ভিন্ন হয়;উচ্চ প্রান্তে, আলফা-হেলিকাল আকারে হোক বাβ-ভাঁজ, bitropic গঠন সাধারণ বৈশিষ্ট্য.