পেপটাইড কাস্টম সংশ্লেষণে পেপটাইড বন্ড গঠনের নীতি কীভাবে?

পৃষ্ঠের উপর, পেপটাইড বন্ধন গঠন, ডিপেপটাইড উত্পাদন, একটি সহজ রাসায়নিক প্রক্রিয়া।এর মানে হল যে দুটি অ্যামিনো অ্যাসিড উপাদান ডিহাইড্রেটেড হওয়ার সময় একটি পেপটাইড বন্ড, একটি অ্যামাইড বন্ড দ্বারা সংযুক্ত থাকে।

পেপটাইড বন্ড গঠন হল হালকা প্রতিক্রিয়া অবস্থার অধীনে একটি অ্যামিনো অ্যাসিড সক্রিয়করণ।(A) কার্বক্সিল আংশিক, দ্বিতীয় অ্যামিনো অ্যাসিড (B) নিউক্লিওফিলিক সক্রিয় কার্বক্সিল মোয়েটি তারপর ডিপেপটাইড (AB) গঠন করে।"যদি কার্বক্সিল উপাদান (A) সুরক্ষিত না থাকে, তাহলে পেপটাইড বন্ডের গঠন নিয়ন্ত্রণ করা যাবে না।"রৈখিক এবং চক্রীয় পেপটাইডের মতো উপজাতগুলি লক্ষ্য যৌগ AB এর সাথে মিশ্রিত হতে পারে।অতএব, পেপটাইড বন্ড গঠনের সাথে জড়িত নয় এমন সমস্ত কার্যকরী গোষ্ঠীগুলিকে পেপটাইড সংশ্লেষণের সময় সাময়িকভাবে বিপরীত পদ্ধতিতে সুরক্ষিত করতে হবে।

সুতরাং, পেপটাইড সংশ্লেষণ - প্রতিটি পেপটাইড বন্ধনের গঠন - একত্রিতকরণের তিনটি ধাপ জড়িত।

প্রথম ধাপ হল কিছু অ্যামিনো অ্যাসিড প্রস্তুত করা যার সুরক্ষা প্রয়োজন, এবং অ্যামিনো অ্যাসিডের zwitterionic গঠন আর বিদ্যমান নেই।

দ্বিতীয় ধাপ হল পেপটাইড বন্ড গঠনের জন্য একটি দ্বি-পদক্ষেপের প্রতিক্রিয়া, যেখানে এন-সুরক্ষিত অ্যামিনো অ্যাসিডের কার্বক্সিল গ্রুপ প্রথমে সক্রিয় মধ্যবর্তীতে সক্রিয় হয় এবং তারপর পেপটাইড বন্ধন তৈরি হয়।এই মিলিত প্রতিক্রিয়া এক-পদক্ষেপ প্রতিক্রিয়া হিসাবে বা দুটি অনুক্রমিক প্রতিক্রিয়া হিসাবে ঘটতে পারে।

তৃতীয় ধাপ হল নির্বাচনী অপসারণ বা প্রতিরক্ষামূলক বেস সম্পূর্ণ অপসারণ।যদিও সমস্ত অপসারণ শুধুমাত্র সমস্ত পেপটাইড চেইন একত্রিত হওয়ার পরে ঘটতে পারে, পেপটাইড সংশ্লেষণ চালিয়ে যাওয়ার জন্য প্রতিরক্ষামূলক গোষ্ঠীগুলির নির্বাচনী অপসারণও প্রয়োজন।

 肽键2

কারণ 10টি অ্যামিনো অ্যাসিড (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec এবং Cys) সাইড চেইন ফাংশনাল গ্রুপ ধারণ করে, যার জন্য নির্বাচনী সুরক্ষা প্রয়োজন, পেপটাইড সংশ্লেষণকে আরও জটিল করে তোলে।অস্থায়ী এবং আধা-স্থায়ী সুরক্ষা ঘাঁটি অবশ্যই আলাদা করা উচিত কারণ নির্বাচনের জন্য বিভিন্ন প্রয়োজনীয়তা রয়েছে।অস্থায়ী সুরক্ষা গোষ্ঠীগুলি পরবর্তী ধাপে অ্যামিনো অ্যাসিড বা কার্বক্সিল কার্যকরী গোষ্ঠীগুলির অস্থায়ী সুরক্ষা প্রতিফলিত করতে ব্যবহৃত হয়।অর্ধ-স্থায়ী প্রতিরক্ষামূলক গোষ্ঠীগুলি ইতিমধ্যে গঠিত পেপটাইড বন্ড বা অ্যামিনো অ্যাসিড সাইড চেইনগুলিতে হস্তক্ষেপ না করেই সরানো হয়, কখনও কখনও সংশ্লেষণের সময়।

"আদর্শভাবে, কার্বক্সিল উপাদানের সক্রিয়করণ এবং পরবর্তীতে পেপটাইড বন্ডের গঠন (কাপলিং প্রতিক্রিয়া) দ্রুত হওয়া উচিত, রেসিমিক বা উপ-পণ্য গঠন ছাড়াই, এবং উচ্চ ফলন অর্জনের জন্য মোলার বিক্রিয়াক প্রয়োগ করা উচিত।"দুর্ভাগ্যবশত, রাসায়নিক সংযোগ পদ্ধতিগুলির মধ্যে কোনটিই এই প্রয়োজনীয়তাগুলি পূরণ করে না এবং কয়েকটি ব্যবহারিক সংশ্লেষণের জন্য উপযুক্ত।

 肽键3

পেপটাইড সংশ্লেষণের সময়, বিভিন্ন প্রতিক্রিয়ার সাথে জড়িত কার্যকরী গোষ্ঠীগুলি সাধারণত ম্যানুয়াল কেন্দ্রের সাথে যুক্ত থাকে, গ্লাইসিন একমাত্র ব্যতিক্রম, এবং ঘূর্ণনের একটি সম্ভাব্য ঝুঁকি থাকে।

পেপটাইড সংশ্লেষণ চক্রের চূড়ান্ত ধাপ হল সমস্ত প্রতিরক্ষামূলক গ্রুপ অপসারণ।ডিপেপটাইড সংশ্লেষণে সুরক্ষা সম্পূর্ণ অপসারণের প্রয়োজনীয়তার পাশাপাশি পেপটাইড চেইন এক্সটেনশনের জন্য প্রতিরক্ষামূলক গোষ্ঠীগুলির নির্বাচনী অপসারণ গুরুত্বপূর্ণ।সিন্থেটিক কৌশলগুলি সাবধানে পরিকল্পনা করা উচিত।কৌশলগত পছন্দের উপর নির্ভর করে, N বেছে বেছে α-অ্যামিনো বা কার্বক্সিল রক্ষাকারী গোষ্ঠীগুলিকে অপসারণ করতে পারে।"কৌশল" শব্দটি পৃথক অ্যামিনো অ্যাসিডের ঘনীভূত প্রতিক্রিয়ার ক্রমকে বোঝায়।সাধারণভাবে, ধীরে ধীরে সংশ্লেষণ এবং খণ্ড ঘনীভবনের মধ্যে পার্থক্য রয়েছে।পেপটাইড সংশ্লেষণ ("প্রচলিত সংশ্লেষণ" নামেও পরিচিত) সমাধানে সঞ্চালিত হয়।বেশিরভাগ ক্ষেত্রে, পেপটাইড চেইনের ক্রমান্বয়ে প্রসারিত করা শুধুমাত্র পেপটাইড চেইন ব্যবহার করে সংশ্লেষিত হতে পারে ছোট টুকরোগুলোকে সংশ্লেষিত করার জন্য।দীর্ঘ পেপটাইড সংশ্লেষণ করতে, লক্ষ্য অণুগুলিকে অবশ্যই উপযুক্ত খণ্ডে ভাগ করতে হবে এবং নির্ধারণ করতে হবে যে তারা সি টার্মিনাসে পার্থক্যের মাত্রা কমিয়ে আনতে পারে।স্বতন্ত্র খণ্ডগুলি ধীরে ধীরে একত্রিত হওয়ার পরে, লক্ষ্য যৌগটি যুক্ত করা হবে।পেপটাইড সংশ্লেষণের কৌশলের মধ্যে রয়েছে সেরা এবং সবচেয়ে উপযুক্ত প্রতিরক্ষামূলক খণ্ডের নির্বাচন, এবং পেপটাইড সংশ্লেষণের কৌশলটির মধ্যে রয়েছে প্রতিরক্ষামূলক ভিত্তিগুলির সবচেয়ে উপযুক্ত সংমিশ্রণ এবং খণ্ড সংযোজনের সর্বোত্তম পদ্ধতি নির্বাচন।


পোস্টের সময়: জুলাই-১৯-২০২৩