অনেক ধরণের ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইড রয়েছে এবং তাদের শ্রেণীবিভাগ ভৌত এবং রাসায়নিক বৈশিষ্ট্য, উত্স, ইনজেশন মেকানিজম এবং বায়োমেডিকাল অ্যাপ্লিকেশনগুলির উপর ভিত্তি করে।তাদের ভৌত এবং রাসায়নিক বৈশিষ্ট্য অনুসারে, ঝিল্লি ভেদকারী পেপটাইডগুলিকে তিন প্রকারে বিভক্ত করা যেতে পারে: ক্যাটানিক, অ্যামফিফিলিক এবং হাইড্রোফোবিক।ক্যাটানিক এবং অ্যামফিফিলিক মেমব্রেন ভেদকারী পেপটাইডের জন্য 85%, যেখানে হাইড্রোফোবিক মেমব্রেন ভেদকারী পেপটাইডের জন্য শুধুমাত্র 15%।
1. ক্যাটানিক মেমব্রেন ভেদকারী পেপটাইড
ক্যাটানিক ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইডগুলি আর্জিনাইন, লাইসিন এবং হিস্টিডিন সমৃদ্ধ ছোট পেপটাইড দ্বারা গঠিত, যেমন TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 এবং DPV6।তাদের মধ্যে, আরজিনিনে গুয়ানিডিন রয়েছে, যা কোষের ঝিল্লিতে নেতিবাচক চার্জযুক্ত ফসফরিক অ্যাসিড গ্রুপগুলির সাথে হাইড্রোজেন বন্ধন করতে পারে এবং শারীরবৃত্তীয় PH মানের শর্তে ঝিল্লিতে ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইডগুলিকে মধ্যস্থতা করতে পারে।অলিগারজিনিনের (3 R থেকে 12 R পর্যন্ত) গবেষণায় দেখা গেছে যে ঝিল্লি অনুপ্রবেশ ক্ষমতা তখনই অর্জিত হয়েছিল যখন আরজিনিনের পরিমাণ 8-এর মতো কম ছিল এবং আরজিনিনের পরিমাণ বৃদ্ধির সাথে সাথে ঝিল্লি অনুপ্রবেশ ক্ষমতা ধীরে ধীরে বৃদ্ধি পায়।লাইসিন, যদিও আর্জিনিনের মতো ক্যাটানিক, গুয়ানিডিন ধারণ করে না, তাই যখন এটি একা থাকে, তখন এর ঝিল্লি অনুপ্রবেশের দক্ষতা খুব বেশি হয় না।ফুটাকি এট আল।(2001) পাওয়া গেছে যে ভাল ঝিল্লি অনুপ্রবেশ প্রভাব শুধুমাত্র তখনই অর্জন করা যেতে পারে যখন cationic কোষ ঝিল্লি অনুপ্রবেশকারী পেপটাইডে কমপক্ষে 8টি ইতিবাচক চার্জযুক্ত অ্যামিনো অ্যাসিড থাকে।যদিও ইতিবাচক চার্জযুক্ত অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশগুলি ঝিল্লি ভেদ করার জন্য অনুপ্রবেশকারী পেপটাইডগুলির জন্য অপরিহার্য, অন্যান্য অ্যামিনো অ্যাসিডগুলিও সমানভাবে গুরুত্বপূর্ণ, যেমন W14 যখন F-তে রূপান্তরিত হয়, পেনেট্রেটিনের অনুপ্রবেশযোগ্যতা হারিয়ে যায়।
ক্যাটানিক ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইডের একটি বিশেষ শ্রেণী হল নিউক্লিয়ার লোকালাইজেশন সিকোয়েন্স (এনএলএস), যা আর্জিনাইন, লাইসিন এবং প্রোলিন সমৃদ্ধ ছোট পেপটাইড নিয়ে গঠিত এবং পারমাণবিক ছিদ্র কমপ্লেক্সের মাধ্যমে নিউক্লিয়াসে পরিবহন করা যেতে পারে।এনএলএসগুলিকে আরও একক এবং ডাবল টাইপিংয়ে ভাগ করা যেতে পারে, যথাক্রমে এক এবং দুটি মৌলিক অ্যামিনো অ্যাসিডের ক্লাস্টার নিয়ে গঠিত।উদাহরণস্বরূপ, সিমিয়ান ভাইরাস 40(SV40) থেকে PKKKRKV হল একটি একক টাইপিং NLS, যখন নিউক্লিয়ার প্রোটিন হল একটি ডাবল টাইপিং NLS।KRPAATKKAGQAKKKL হল সংক্ষিপ্ত ক্রম যা ঝিল্লি ট্রান্সমেমব্রেনে ভূমিকা পালন করতে পারে।যেহেতু বেশিরভাগ NLS-এর চার্জ সংখ্যা 8-এর কম, তাই NLSগুলি কার্যকর ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইড নয়, কিন্তু তারা কার্যকর ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইড হতে পারে যখন অ্যামফিফিলিক ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইড গঠনের জন্য হাইড্রোফোবিক পেপটাইড সিকোয়েন্সের সাথে সমন্বিতভাবে যুক্ত হয়।
2. অ্যামফিফিলিক ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইড
অ্যামফিফিলিক ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইডগুলি হাইড্রোফিলিক এবং হাইড্রোফোবিক ডোমেন নিয়ে গঠিত, যেগুলিকে প্রাথমিক অ্যাম্ফিফিলিক, সেকেন্ডারি α-হেলিকাল অ্যাম্ফিফিলিক, β-ফোল্ডিং অ্যামফিফিলিক এবং প্রোলিন-সমৃদ্ধ অ্যাম্ফিফিলিকে ভাগ করা যায়।
প্রাথমিক প্রকারের অ্যামফিফিলিক পরিধানের ঝিল্লি পেপটাইডগুলি দুটি বিভাগে বিভক্ত, এনএলএস সহ শ্রেণী সহযোগে হাইড্রোফোবিক পেপটাইড ক্রম দ্বারা সংযুক্ত, যেমন MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) এবং Pep - 1 (KETWWETWTEWTEWTEWSQVKRK0-এর উপর ভিত্তি করে পারমাণবিক চিহ্ন উভয়ই SQVKVRK0-এর স্থানীয়করণ। , যার মধ্যে হাইড্রোফোবিক MPG এর ডোমেন এইচআইভি গ্লাইকোপ্রোটিন 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A) এর ফিউশন সিকোয়েন্সের সাথে সম্পর্কিত, এবং Pep-1 এর হাইড্রোফোবিক ডোমেন উচ্চ ঝিল্লি অ্যাফিনিটি (KETWWET WWTEW) সহ ট্রিপটোফান সমৃদ্ধ ক্লাস্টারের সাথে সম্পর্কিত।যাইহোক, উভয়ের হাইড্রোফোবিক ডোমেন WSQP এর মাধ্যমে পারমাণবিক স্থানীয়করণ সংকেত PKKKRKV এর সাথে সংযুক্ত।প্রাথমিক অ্যামফিফিলিক ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইডের আরেকটি শ্রেণী প্রাকৃতিক প্রোটিন থেকে বিচ্ছিন্ন ছিল, যেমন pVEC, ARF(1-22) এবং BPrPr(1-28)।
সেকেন্ডারি α-হেলিকাল অ্যামফিফিলিক ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইডগুলি α-হেলিসেসের মাধ্যমে ঝিল্লির সাথে আবদ্ধ হয় এবং তাদের হাইড্রোফিলিক এবং হাইড্রোফোবিক অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ হেলিকাল কাঠামোর বিভিন্ন পৃষ্ঠে অবস্থিত, যেমন MAP (KLALKLALK ALKAALKLA)।বিটা পেপটাইড ফোল্ডিং টাইপ অ্যামফিফিলিক পরিধানের ঝিল্লির জন্য, একটি বিটা প্লিটেড শীট তৈরি করার ক্ষমতা তার ঝিল্লির অনুপ্রবেশ ক্ষমতার জন্য গুরুত্বপূর্ণ, যেমন VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) মেমব্রেনের অনুপ্রবেশ ক্ষমতা গবেষণার প্রক্রিয়ায়, ডিএমব্রেন ব্যবহার করে - অ্যামিনো অ্যাসিড মিউটেশন অ্যানালগগুলি বিটা ভাঁজ করা টুকরো তৈরি করতে পারে না, ঝিল্লির অনুপ্রবেশ ক্ষমতা খুব খারাপ।প্রোলিন-সমৃদ্ধ অ্যামফিফিলিক ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইডগুলিতে, পলিপ্রোলিন II (PPII) সহজেই বিশুদ্ধ জলে গঠিত হয় যখন প্রোলিন পলিপেপটাইড কাঠামোতে অত্যন্ত সমৃদ্ধ হয়।PPII হল একটি বাঁ-হাতি হেলিক্স যার প্রতি টার্নে 3.0 অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ রয়েছে, যা স্ট্যান্ডার্ড ডান-হাতের আলফা-হেলিক্স কাঠামোর বিপরীতে প্রতি টার্নে 3.6 অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ রয়েছে।প্রোলিন-সমৃদ্ধ অ্যামফিফিলিক ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইডের মধ্যে রয়েছে বোভাইন অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল পেপটাইড 7(Bac7), সিন্থেটিক পলিপেপটাইড (PPR)n(n হতে পারে 3, 4, 5 এবং 6), ইত্যাদি।
3. হাইড্রোফোবিক ঝিল্লি অনুপ্রবেশকারী পেপটাইড
হাইড্রোফোবিক ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইডে শুধুমাত্র নন-পোলার অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ থাকে, যার নেট চার্জ অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সের মোট চার্জের 20% এর কম থাকে, অথবা হাইড্রোফোবিক মোয়েটি বা রাসায়নিক গ্রুপ থাকে যা ট্রান্সমেমব্রেনের জন্য অপরিহার্য।যদিও এই সেলুলার ট্রান্সমেমব্রেন পেপটাইডগুলি প্রায়শই উপেক্ষা করা হয়, তবে এগুলি বিদ্যমান, যেমন ফাইব্রোব্লাস্ট গ্রোথ ফ্যাক্টর (K-FGF) এবং ফাইব্রোব্লাস্ট গ্রোথ ফ্যাক্টর 12 (F-GF12) কাপোসির সারকোমা থেকে।
পোস্টের সময়: মার্চ-19-2023